Biyofiltreler, içinde özel dolgu maddesi (ağaç kabuğu vb.) kullanılarak dolgu maddesi üzerinde gelişen mikroorganizmaların koku kaynağı içindeki zararlı bileşikleri arıtmasıdır. Özellikle büyük yüzey alanı gerektiren durumlarda betonarme de yapılabilen biyofiltrelerde dolgu maddesinin belli oranda nemlendirilmesi gerekmektedir.